Pompeu va traslladar molts jueus a Roma (63 aC), formant-se allà una colònia molt nombrosa. Dins d'aquesta comunitat, es va originar la primera comunitat cristiana a través de la predicació de Pere. El 49 aC, els jueus van ser expulsats de Roma a causa de les pertorbacions que provoquen. En aquest moment, Pere també va haver de marxar; el 50 aC es troba a Jerusalem, d'allà va a Antioquia i recorre l'Àsia Menor. Cap al 56, Neron va permetre el retorn dels jueus, i amb ells va tornar Pere. Va romandre allà, amb interrupcions, fins a la seva mort. Mentre era emperador, Neron va ser empresonat i tancat, potser a la presó de Mamertina. Mentre esperava l'hora de la mort, va convertir els seus carcellers Procès i Martinià.
Va ser clavat en la creu, i per desig propi, va ser posat amb el cap cap avall, per diferenciar-se així del seu Mestre. Tot això va succeir a la colina vaticana, on ara s'aixeca la basílica de Sant Pere.